팀명
DNAI
팀원 명단
정용환, 박장원
지도교수
김경섭교수님
작품 배경 및 목적
다른 분야의 연구에 AI기술이 접목 되고 있다. 그중 DNA분석 연구에 사용되는 툴은 linux환경에서 동작하며, 연구의 시퀀스마다 사용되는 툴이 많다. 그래서 연구자들은 각각 설치하는 불편함이 있었고, 사용할 때마다 커맨드를 통해서 옵션을 지정해야 하는 문제점이 있다.
분석의 시퀀스에 따라서 사용되는 툴이 여러가지이고, 연구자마다 사용하는 툴과 툴의 옵션 또한 다르다. 그 중에서도 연구에 많이 사용되는 툴을 과정에 따라 파이프라이닝을 통해 엮어내고, 사용자의 옵션(ex. 최소길이, 반복횟수, 정확도등)을 저장하여 옵션대로 실행하여 사용의 편의성을 높이는 것 이 작품의 목적입니다.
작품 내용
Shotgun metagenomic sequencing은 크게 quality control -> Assembly -> binning -> classification & analysis 과정을 따른다. 이때, classification & analysis은 연구자의 개인 시각화자료들을 통해서 연구를 진행하는 경우가 많아 제외하고, 나머지 quality control -> Assembly -> binning과정을 파이프라이닝을 통해 시퀀스를 진행시켜 주고, 툴별로 설정할 수 있는 옵션(ex. 최소길이, 반복횟수, 정확도등)을 사용자가 저장 시켜두면, 저장된 옵션대로 시퀀스를 진행시켜 연구의 편의성을 최대한 강조한 작품이다..
Commentaires